Добрый день.
Для одной операции сверления например G81, есть один Spoint и один Rpoint куда Вы и выходите. Код G98/G99 указывает в начале цикла куда именно нужно выйти в S, или R .
-------------------
Если Вы имеете ввиду - Фрезу (а не сверло), то выход происходит с помощью G00.
В двух случаях есть 2 уровня безопасности, и только по оси Z, поэтому выходите Вы после обработки действительно в других координатах X,Y но на один и тот же уровень по Z (это и есть уровень безопасности)